Третья часть для такой емкости многовато... 20-25% максимум, а то и 15% за глаза... большое подсвежение для рыб тоже стресс- а на нем болячки...недели 2-3 воду не подменивайте -на место испарившейся добавляйте кипяченую холодную воду...а потом начинайте подмены...

Чем кормите и как...и что за сом...

Сом пусть живет если конечно он Анциструс... все морские ракушки на выброс из аквариума и крашенный грунт тоже бы- потому как может фонить (выбрасывать в воду всякую бяку)...
Корм хлопья- это нормально...если только фирменных производителей типа Тетра ,Сера и т.д...кормит один человек...перед кормлением выключаете помпу на 10-15- потом включаете ...кормите макс 5 минут по поедаемости...
Для более комфортного содержания рыб при подменах воды и при посадке новых можно добавлять кондиционер воды СераАкутан или такой же тетровский ...

С какой целью кипяченую?

И я бы ещё рекомендовал выброс фильтра направить вверх под 90 градусов или в стенку. Для такого аквариума "голова" достаточно мощная поэтому, предполагаю, что гуппи с неонами болтаются там как в миксере.

Я ж написал -=морские ракушки=!!!!!!!!!!...пресноводные пусть живут или у вас живые морские проживают в пресном аквариуме...рыбы то ж пусть живут...

В маленьких аквариумах лучше подливать кипяченую ( именно в данном случае к автору темы) - она не в такой степени смещает внутренние параметры биобаланса на данный момент , чем отстоянная или тем более из подкрана- да и поддержать уровень воды для визуальности , чем смотреть на белые разводы от испарившейся воды...хотя если вода мягкая , как в Питере смысла лить кипяченую нет...

вода у вас какая?
жесткость?
неоны и тернеции дохнут тоже?

40 л не 200
я бы все же дезинфекцию сделала
растения на 30 мин в слабо- розовый марганцовки
потом промыть под струей Т около 30С
грунт кипятить минут 30
промыть
аквариум я промываю кашицей соды с лимонной кислотой
через полчаса промываю проточной
можно еще промыть водкой(не шучу) и затем проточной