А откуда это известно, позвольте осведомиться?

Ну то что бактериалка там присутствует - это почти на 100% правильно. Но бактериалка скорее всего вторична. А вот первичным может быть все что угодно. Я склоняюсь к вирусному заболеванию.
Вы написали что лечите рыбу ципрофлоксацином. Есть положительная динамика? Если нет, то скорее всего бактериалка там мало выражена.
Но для очистки совести я бы все-таки попробовал бы бактопур.
Что касается метрогила.. Он как раз может помочь в Вашем случае, потому что воздействует как на анаэробные инфекции, так и на обычные. Неплохо справляется с лямблиозом и амебиазом. Так что попробуйте - хуже точно не будет.
И еще.
У вас в аквариуме жесткая вода? Можете сказать сколько у вас общая и карбонатная жесткость?

Каким бактопуром лечить я не скажу, потому что сам всегда пользовался самым обычным раствором и его действие меня вполне устраивало. А в последние пару лет я перешел на протазол и тремазол. Использую их при первичном пролечивание дикой рыбы.
Связь фильтра и болезни случайны.
Гурами частенько покрываются подобными язвами находясь в излишне жесткой и грязной воде и на не полноценном корме.
Совмещать оба лекарства можно.