У меня есть подобный опыт. Перед запуском Аквариума Мечты, половину лета и до первых морозов у тещи на даче замачивал коряги всяческие, тоже в основном с корой. Замачивал в ванне бэушной на улице. Часть коряг вишня, часть неопознанных. Поскольку бывал там редко, все это хозяйство нехило бродило! Вода была черная с дурным запахом! Когда я это нечто увидел впервые, то первая мысль была-срочно подменить воду! Теща очень обрадовалась возможности использовать "такое добро" на полив грядок!
Короче! Думаю, что кору надо ободрать! Вода первое время будет "не айс", подменять придется часто. Дафниям быть не раньше, чем все процессы устаканятся. Месяца два будут хлопотными.
А вообще очень интересный проект! Буду следить!

Да, еще забыл сказать! Растения в эту ванну при "запуске" высаживал в горшках. Разные, и анубы, и валька, и папоротники! Выжили в черной вонючей воде только "чертики", у нас так комариных личинок называют.

Никогда никак не подготавливал коряги. Как нашёл или отпилил - так и сунул в аквариум.

Гнилая кора и древесина - отличный корм для анциструсов, хоть и пустоватый. Для дафний водоросли нужны.

Дафнии скорее всего благополучно отойдут в мир иной , также никогда не обрабатывал коряги, но у вас немного другая история из-за количества, сейчас у вас вода перенасыщена дубильными веществами и соками древесины, в ней даже бактерии хуже развиваться и падает растворимость кислорода, да такой водой шикарно лечить многие рыбьи болячки, но ИМХО для жизни рыб она пока не подходит , делайте первое время подмены почаще, и да дафнии питаються водорослями а не выделениями коряжника

А вообще прямо шикарный биотоп каких-либо неончиков

Влад, у него по-моему их многовато. Да и о подменах ты умолчал.

И еще по теме коряжника - пока не пройдет бактериальная вспышка и вода не перестанет быть мутной и вязкой рыб лучше не запускать.
Пусть стоит и устаканивается.

Дафнии не только водорослями питаются. И не только дрожжами. У меня они с удовольствием лопают рыбий корм, и подозреваю, что не только сухой. Во всяком случае при добавлении науплий артемии в то место быстро слетались дафнии со всего аквариума. То же самое происходило при добавлении нематоды. Хотя случай с нематодой я объяснял наличием неотмытых частичек питательной среды.

А коряжки я кидал с корой, когда поплыл малек анциструсов. Читал, что они лопают бактериальные обрастания, которыми коряжки покрываются уже на 2-3 день. Фигвам! И коряжки, и обрастания анцики мои игнорировали, зато там паслись стада из мальков данюшек, креветок и катушек. Но через некоторое время мальки начинали массово гибнуть, и пришлось коряжки подрезать и зашкурить, и в таком виде они пребывают там по сей день