Это хамелионская защитная окраска на вашем светлом грунте...

Да ,грунт у вас не супер, поменяйте его на более естественный.Да и в аквасе пустовато,растений туда, корягу.А объем у вас маловат , или мне так кажется? Для такого зверя нужен аквас 200-250л , т.к вырастает рыбка до 30-50см.

1. Пятно - не болезнь.
2. Грунт - нереально омерзителен по цветам! Выкиньте его, насыпьте грунт НАТУРАЛЬНОГО цвета.
3. Птеригоплихту для правильного пищеварения нужна в аквариуме НАТУРАЛЬНАЯ (деревянная, а не пластиковая и не керамическая!) коряга. Как ее готовить - см. рецепты на форуме.
4. Растения должны быть не "в другой стороне", а составлять основное содержимое аквариума.
5. RTF FAQ!

У Вас действительно есть живые растения при таком грунте - в том числе, толщине его слоя, фракции т.д.? Или мне кажется, что дно аквариума на фото местами видно?

Птеры растут быстро, очень скоро ему станет катастрофически тесно и лучше об этом подумать заранее. Мой (35 см) в 57 литрах сидел бы, как килька в банке, вернее, не сидел бы, а загнулся.

Это просто натуральный грунт, который намного больше подходит рыбе для жизни (о вкусах не спорят, поэтому эстетическую сторону вопроса не рассматриваю). Окатанная галька, фракция 3-5 мм, обязательно без острых краев. Бывает разных цветов - природных.

Как правило, птер идет пятнами, если находится в стрессе. А стресс очень часто способствует возникновению болезни.