Пока просто в виде черновика цитат.
"Ихтиофонус может поражать морскую рыбу, в том числе и мускулатуру рыб (филе), поэтому "необходима термическая обработка морской рыбы, используемой в корм". Это цитата из Ихтиопатологии под ред Головиной, 2007 год.

"Заражение происходит алиментарным путем, при заглатывании рыбой спор, поступающих в воду из кишечника больной рыбы, или при скармливании ей фарша из мяса преимущественно морских рыб, инфицированных ихтиоспоридиями."
Это отсюда http://www.cnshb.ru/AKDiL/0033/default.shtm

От Dr.Vladson
"Туберкулез на 90% передается как раз из морской рыбы. Так что всплеску заболеваемости туберкулезом в аквариумах мы обязаны, в том числе, и активному использованию фаршей из морской рыбы."

"Но с учетом того, что из, кажется, семнадцати видов микобактерий - 15 (или около того) живут в соленной воде... Как-то вероятность заноса с морской рыбой становится весьма серьезной."

От В.К.
"Вот про треску, минтай и путассу есть у меня сомнения. По мимо того, что с морской рыбой велика вероятность занести нематод анизакид и ихтиофоноз..."
Дальше идет про антипитательные свойства рыбы(без достаточной тепловой обработки(40 мин))проявляющиеся при использовании некоторых видов...
Также благодарю Вадимыча и Schz за "наводки" на нужную информацию.
---------------------------------------------------------------------------------------------------------
Добавлено 13.01.2014.
По ихтиофонозу сельди.

"Влияние эпизоотии ихтиофоноза на популяцию атлантическо-скандинавской (норвежской весенне-нерестующей) сельди :Clupea harengus harengus L.я

http://www.dissercat.com/content/vliyanie-ep...

По выше указанной ссылке речь идет, в частности, и о серьезной смертности от ихтиофоноза:

"(...)В развитии эпизоотии ихтиофоноза в Норвежском море 1990-2001 гг. были выявлены 2 завершенных и 1 незавершенный цикл с периодом 3-4 года и общей тенденцией к спаду заболеваемости. Смертность, по результатам изучения патологических изменений в организме и скорости развития заболевания, за каждый из 3 периодов составила примерно 40-55 % от нерестового запаса.(...) "

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

По-видимому определенные риски присутствуют и при использовании в кормлении аквариумных рыб икры мойвы.
В частности :
"(...)
Мойва – Mallotus villosus
Основные болезни и паразиты.
Внутренние органы

1. В полости тела, реже в ткани яичника, встречаются овальные цисты
диаметром до 2 мм, принадлежащие микроспоридии рода глюгэй. Цисты запол-
нены огромным количеством мельчайших спор, изучить которые можно только
под большим увеличением микроскопа (1200х).
(...)"

Цитата из:
"Гаевская А. В. Паразиты и болезни морских и океанических рыб в природных и
искусственных условиях. – Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2004. – с. 237."

-----------------------------------------------------------------------------------------------------------