Жалеть нужно не кораллы, а рыбок... Впрочем, с опытом вы сможете и их смело использовать.
Насчет корма опечатка - все должно съедаться за 15 сек. Кормить надо поменьше, но чаще, тогда будет все Оk.

Мне кажется, что, в основном, Вы запускали правильно. Кипячение грунта, хоть и ненужное мероприятие, к каким-то радикальным последствиям привести не могло. У Вас же аквариум после этого простоял две недели без рыб. Замена 3-х литров перед посадкой рыбы - тоже не причина. Но воду не нужно использовать питьевую, лучше из-под крана, с добавлением кондиционера. Можно ее предварительно отстоять.
В целом, присоделиняюсь к Сергелю - подождала бы несколько дней, если все будет в порядке с оставшимися неонами - просто докупила бы еще несколько. Если с оставшимися что-то не так, но непонятно что, и симптомов болезни явных нет - сменила бы часть воды постепенно и понемногу. Непонятны параметры воды в бутылке...
А по поводу кормления - не переживайте, рыбу ни в коем случае нельзя перекармливать, гораздо лучше и полезнее недокормить. По целому ряду причин. У Вас рыб совсем мало и мелкие, им даже не щепоточка нужна, а совсем крупинок несколько. Все должны съесть максимум за минуту. Если что-то остается - значит, перекармливаете. В маленьком объеме это вдвойне опасно.
Кораллы и ракушки лучше убрать. Удачи.

Будем надеяться, что все у Вас получится

если вы их кормите так, что бы они ели 15 мин. сухой корм, то в первую очередь — объелись. Рекомендация кормить в течение 15 мин. относится только к кормлению живыми дафниями и циклопами. Сухой корм надо давать из расчёта, буквально, по крупинке-другой для каждой рыбки.

Еще, сухой корм нужно предварительно размачивать, без этого их животики тоже могут пухнуть.