при разложении органики выделяется очень ядовитый аммиак NH3, который в воде сразу частично переходит в аммоний NH4(который не ядовит, но при определённых условиях переходит обратно в аммиак).
Это неверно. Аммоний тоже весьма ядовит, просто аммиак быстрее убивает. На самом деле, все зависит исключительно от pH - при высоком pH (при pH >7.5) возрастает доля свободного аммиака, а в кислой среде больше ионов аммония.
Очень неплохо про аммиак и аммоний написано в статье
Вообщем-то важно, чтобы аммиака и аммония вообще не было.
Совершенно верно